Theodor Diener teve um problema. Era 1967, e ele e um colega haviam isolado com sucesso o agente infeccioso causador da doença do tubérculo do fuso da batata, que devasta as plantações. Mas não era como nada que eles reconhecessem. Embora eles o chamassem de vírus, ele não se comportou como um.

Diener levou quatro anos para demonstrar que a entidade misteriosa era algo ainda mais simples do que um vírus: uma única molécula “nua” que poderia infectar as células das plantas de batata e, assim, se reproduzir. Ele sugeriu chamá-lo de viróide. Foi o menor agente replicante já identificado. De uma só vez, Diener expandiu nossa compreensão da vida no mundo microscópico.
Você pode pensar que uma descoberta tão dramática se tornaria, er, viral. No entanto, quase ninguém percebeu. Além de alguns outros patologistas de plantas, o mundo científico se esqueceu dos viróides por meio século. Eles eram tão obscuros que, em 2020, quando Benjamin Lee, do Centro Nacional de Informações sobre Biotecnologia em Bethesda, Maryland, foi aconselhado a tentar investigar viróides, ele nunca tinha ouvido falar deles.
Desde então, graças a Lee e outros, houve uma explosão de descobertas. Agora sabemos de milhares de viróides e entidades semelhantes a viróides, com nomes exóticos como obeliscos, ribozivírus e satélites. Eles parecem estar em toda parte, em uma enorme variedade de organismos e microorganismos. Não temos ideia do que a maioria deles está fazendo, incluindo se são benignos ou perigosos. Mas esses replicadores mais simples possíveis levantam questões fundamentais sobre o que significa estar vivo. Eles podem até datar das origens da vida.
Parte da história da biologia ao longo dos séculos tem sido a busca por formas de vida cada vez menores. Tudo começou na década de 1670, quando Antonie van Leeuwenhoek, um mestre em microscópios e lentes, observou minúsculos “animálculos” vivendo na água da chuva. Os biólogos acabaram percebendo que se tratava de organismos unicelulares, que incluem bactérias e leveduras. Os mais minúsculos têm apenas alguns micrômetros de diâmetro, mas são incrivelmente intrincados, contendo centenas de tipos diferentes de moléculas – incluindo o DNA que carrega seus genes.

Passaram-se mais de dois séculos até que o botânico Dmitri Ivanovsky descobrisse algo ainda menor. Na tentativa de descobrir o que estava causando outra doença nas plantas de batata, ele conseguiu pegar o culpado usando um filtro incrivelmente fino. Em 1898, o microbiologista Martinus Beijerinck deu um nome a esse tipo de agente infeccioso:vírus. Os vírus consistem em um pedaço de material genético – DNA ou uma molécula semelhante chamada RNA – envolto em uma casca, ou capsídeo, feito de proteína. Eles são frequentemente um décimo de micrômetro de diâmetro e alguns são ainda menores. Sozinhos, eles não podem se multiplicar. Mas se infectarem uma célula viva, podem assumir o controle de sua maquinaria interna e usá-la para produzir milhares de novos vírus. As células são destruídas no processo, explicando por que os vírus podem causar doenças graves.
Formas de vida cada vez menores
Os vírus ultrapassaram o limite de quão pequeno um ser vivo pode ser. Mas, sete décadas depois, com Jantar Descoberta de viróides, o envelope começou a se expandir (veja Habitantes do reino invisível). Os viróides consistem em uma fita de RNA sem nem mesmo um capsídeo. Como os vírus, eles se replicam entrando em uma célula hospedeira e subvertendo seus sistemas. Mas o mecanismo preciso é diferente porque o O RNA de um viróide é circular. O viróide assume uma enzima que o hospedeiro usa para produzir seu próprio RNA, que então “anda” ao redor do RNA circular, copiando-o à medida que avança para criar uma longa fita de RNA semelhante a uma fita adesiva com muitas repetições da sequência viróide. Este é cortado em pedaços, cada um contendo uma única cópia do RNA do viróide, e estes então formam loops. Microscópios eletrônicos às vezes mostrar viróides em forma de bastonete, indicando que a alça de RNA é ainda mais torcida e dobrada.
A maneira como os viróides funcionam é única e seu tamanho minúsculo sem precedentes. Mas por décadas, ninguém prestou muita atenção a eles. Mesmo dentro da biologia, eles eram um assunto de nicho. A pesquisa de viróides prosseguiu em um ritmo glacial por 50 anos, diz Zasha Weinberg na Universidade de Leipzig, na Alemanha. Ele suspeita que a falta de interesse foi em parte porque os viróides pareciam infectar apenas as plantas. No entanto, em 2021, Weinberg e seus colegas publicaram um estudo que mudou tudo.
A ironia é que eles nem estavam procurando por viróides. Eles estavam compilando informações sobre ribozimas – moléculas de RNA que também podem atuar como enzimas para acelerar reações bioquímicas – e estavam particularmente interessados em um grupo chamado ribozimas de grampo de cabelo. Com o nome da forma em que a fita de RNA é dobrada, as ribozimas em grampo de cabelo foram Descoberto no final dos anos 1980, mas até 2021 apenas quatro tipos eram conhecidos. Quando os pesquisadores vasculharam um grande volume de dados de sequência genética, tanto DNA quanto RNA, coletados de diferentes espécies ao longo dos anos, eles encontraram 941 novos – expandindo a diversidade em mais de 200 vezes. Em um exame mais detalhado, essas ribozimas foram todas encontradas em sequências circulares de RNA, assim como os viróides. Mas havia algo distinto neles: suas sequências genéticas variavam muito em comprimento, de 381 a 5170 nucleotídeos, enquanto os viróides conhecidos anteriormente abrangiam apenas algumas centenas de nucleotídeos.
“5000 é uma loucura”, diz Weinberg. “Há algo realmente diferente acontecendo aqui.” Além do mais, essas “entidades semelhantes a viróides” não se limitavam às plantas. A equipe de Weinberg os encontrou em vários fungos, formigas de cabeça estreita, uma esponja marinha e um verme de cerdas.
Os viróides e sua laia estão vivos? Devemos vê-los como biológicos ou químicos?
Mais descobertas se seguiram nos dois anos seguintes. Quando um novo sistema projetado para examinar enormes volumes de dados de sequência genética descobriu mais de 100.000 novos vírus de RNA, também encontrou outras entidades estranhas chamadas Satélites. Embora conhecido desde 1960, os satélites permanecem enigmáticos. Superficialmente, eles se assemelham a vírus: um pouco de material genético é cercado por uma casca de proteína. Mas um satélite só pode infectar uma célula se ela se emparelhar com um vírus específico.
Entretanto Lee e seus colegas estavam pesquisando ativamente dados de sequência genética em busca de evidências de novos viróides. Em 2023, eles relataram ter encontrado mais de 11.000 RNAs circulares semelhantes a viróides. Alguns deles parecem ser viróides clássicos, enquanto outros são provavelmente satélites. O conjunto também inclui alguns “ribozyvírus” – eles têm RNA circular e se replicam como um viróide, mas também têm um gene que codifica uma casca de proteína, borrando a linha entre viróides e vírus.
No mesmo ano, uma equipe que incluía Beatriz Navarro no Instituto de Proteção Sustentável de Plantas em Bari, Itália, e Lee relatou novas entidades chamadas ambivírus, que descreveram como “híbridos de vírus de RNA e elementos semelhantes a viróides”. Ao contrário dos viróides clássicos, eles têm um gene que codifica a enzima que copia seu próprio RNA. No entanto, eles ainda dependem de um hospedeiro para se replicar – a equipe os encontrou em fungos.
No ano passado, os pesquisadores descobriram talvez as coisas mais estranhas até agora. Uma equipe liderada por André Fogo na Universidade de Stanford, na Califórnia, identificada entidades no microbioma intestinal humano que, como os viróides, são RNAs circulares, mas dobrados em forma de bastonete – ganhando o nome Obeliscos. Também ao contrário dos viróides clássicos, seus genomas codificam proteínas, apelidadas de oblins, que não têm nenhuma semelhança com nenhuma proteína conhecida e cuja função é um mistério completo. Os pesquisadores encontraram 29.959 tipos distintos de obeliscos.

O que essa série de descobertas deixa muito claro, no entanto, é que existem entidades semelhantes à vida que são ainda menores que os vírus – e estão por toda parte. Não sabemos quantos existem, até porque as ferramentas de pesquisa disponíveis funcionam procurando sequências genéticas familiares, para que não detectem entidades com tipos mais peculiares de RNA. “Acho que estamos apenas arranhando a superfície”, diz Lee.
Os viróides estão realmente vivos?
A enxurrada de descobertas também criou muita confusão. Como podemos subdividir todos esses coisinhas diferentes? As categorias existentes, como viróide e satélite, não capturam toda a variedade. Para aumentar a complexidade, o que começa como um viróide não permanece necessariamente assim. “É muito provável que possa haver transições entre categorias de entidades semelhantes a viróides”, diz Lee. Por exemplo, um viróide pode ganhar o gene de uma proteína, tornando-se um satélite ou vírus, e depois reverter. As sequências de RNA em questão são tão curtas que podem ser facilmente trocadas ou evoluir aleatoriamente em uma grande população de viróides.
Não está claro como devemos pensar sobre os membros desse mundo subviral. Eles estão vivos ou não? Devemos vê-los como biológicos ou são apenas química complicada? Afinal, muitos biólogos hesitam com a ideia de que os vírus estão vivos. “Pessoalmente, acredito que a definição de vida deve ser drasticamente expandida para incluir vírus e viróides, mas essa não é de forma alguma uma visão consensual”, diz Lee. “Eles são claramente replicadores biológicos sujeitos à evolução por seleção natural e é isso que importa para os biólogos.”
A questão mais profunda é que ninguém ainda conseguiu chegar a uma definição de vida que a maioria dos biólogos possa apoiar. “Talvez dependa do contexto da pergunta científica que você está fazendo”, diz Weinberg. Mas essas pequenas entidades estranhas podem ajudar. Tem havido um movimento crescente para Trate a vida como um espectro em vez de um fenômeno sim-não. Nesse caso, os viróides e sua laia estão na base das coisas – eles estão mais vivos do que as rochas, mas não tão vivos quanto as bactérias ou os elefantes.
Outra questão óbvia é de onde vêm todos esses viróides e entidades semelhantes a viróides. Existem duas possibilidades principais. A primeira é que eles se formam espontaneamente dentro de células vivas. Como os viróides são sequências curtas de RNA e todas as células produzem grandes volumes de RNA o tempo todo, não é inconcebível que entidades semelhantes a viróides possam se formar por puro acaso, diz Weinberg. Lee e seu colega Eugênio Koonin argumentaram que Esta é a explicação mais provável, apontando para sequências em genomas de plantas chamadas retrozimas que se assemelham a viróides. “Um replicador pode basicamente crescer pernas e ir embora”, diz Lee.
Se isso for verdade, muitas espécies de viróides podem ter origens bastante recentes – mesmo que o fenômeno geral seja antigo. No entanto, Lee e Koonin escreveram seu artigo antes de todas as descobertas recentes. “Muito disso se baseava no fato de que os viróides eram encontrados apenas em plantas”, diz Lee. Agora sabemos que isso não é verdade. Em vez disso, parece que viróides e entidades semelhantes a viróides são universais. Isso sugere uma segunda possibilidade, que eles podem ser verdadeiramente antigos, que remonta ao alvorecer da vida. “Eles têm todas as características para serem as primeiras entidades a se replicar”, diz Navarro. Eles são pequenos, tornando-os mais fácil de replicar sem muitos erros. Além disso, “são estáveis, porque são compactos”, diz.
Como a vida começou na Terra é um mistério profundo, apesar de décadas de pesquisa sobre a questão. Uma hipótese muito discutida é que suas origens estão no chamado mundo do RNA. Essa ideia foi motivada pela descoberta das primeiras ribozimas no início dos anos 1980: a descoberta de que o RNA poderia atuar como uma enzima, além de armazenar informações genéticas, tornou a molécula uma boa candidata à forma mais simples de vida. Navarro e seus colegas acreditam que os viróides podem ser Relíquias daquela época. “Nossa hipótese é que eles são fósseis do mundo do RNA pré-celular”, diz ela.
Fósseis vivos do alvorecer da vida
No entanto, a ideia ainda não foi comprovada, e Lee diz que tem alguns problemas importantes. Talvez o maior seja que ninguém jamais encontrou uma ribozima na natureza que possa aumentar o tamanho das moléculas de RNA – o que teria sido essencial para um viróide primordial se auto-replicar. No entanto, isso foi alcançado no laboratório. Gerald Joyce no Instituto Salk em La Jolla, Califórnia, usou a evolução artificial para modificar ribozimas. Em 2016, ele e seu colega David Horning Criado um que poderia copiar sequências curtas de RNA. E em março do ano passado, eles desenvolveram um que foi capaz de copiar uma sequência de RNA que incluía uma ribozima. “Esses são comprovadamente muito fáceis de evoluir”, diz Weinberg.
Mas se uma ribozima como essa era essencial no início da vida, pergunta Lee, por que ainda não existe? Ele aceita que poderia simplesmente ter morrido, mas também observa que a vida é diversa e econômica, por isso é estranho que não tenhamos encontrado algo assim em nenhum lugar.
Por enquanto, a questão de saber se entidades semelhantes a viróides são fósseis vivos desde o início da vida permanece em aberto. Mas, em um exemplo agradável de circularidade, é exatamente isso que Diener, o descobridor dos viróides, sugerido em 1989.
Habitantes do reino invisível
Vírus: Uma ou mais fitas de DNA ou RNA, geralmente envoltas em um invólucro de proteína ou capsídeo
Viroid: Uma fita circular de RNA, mas sem capsídeo
Satélite: Uma entidade semelhante a um viróide que depende de um vírus verdadeiro para se replicar
Ribozyvirus: Um satélite com uma fita circular de RNA que codifica um único tipo específico de gene
Obelisco: Uma fita circular de RNA dobrada em forma de bastonete, que produz proteínas misteriosas chamadas oblins
Entidade semelhante a um viróide: Um termo abrangente que abrange viróides, satélites, ribozigvírus, obeliscos e muito mais
Fonte: New Scientist
Descubra mais sobre Florestal Brasil
Assine para receber nossas notícias mais recentes por e-mail.